حکومت قذافی از برخی از کارکنان فرودگاه خواست که بگویند گذرنامه امام موسی صدر را مهر کرده اند. آنها در دادگاه شهادت دروغ گفتند که صدر و همراهانش از لیبی خارج شدهاند.
شلگم، وزیر خارجه سابق لیبی میگوید امام موسی صدر توسط یک شبه نظامی فلسطینی به نام ابوندال که به قذافی نزدیک بود کشته شده اند. یکی از نزدیکان رهبر لیبی معتقد است وزیر ارتباطات قذافی در ناپدید شدن امام موسی صدر دست داشته است.
سرگرد عبدالمنایم الحونی معتقد بود صدر در یک زندان اطلاعات ارتش در ترابلس نگهداری میشده. نگهبان سابق زندان ارتش بعد از سقوط قذافی گفت که بین سالهای ۱۹۹۲ تا ۹۵ نگهبان امام موسی صدر در یک زندان در ترابلس بوده. در آوریل ۲۰۱۲ شورای انتقالی ملی لیبی اعلام کرد بقایای جسد امام موسی صدر در یک گور دسته جمعی در ترابلس پیدا شده، اما آزمایش اولیه دیانای روی لباسهای پیدا شده با امام موسی صدر همخوانی نداشت.
