روزنامه مردمسالاری با بازخوانی اخبار 24 مرداد 87 آورده است:

سه سال پس از تشکيل دولت محمود احمدي نژاد، داود احمدي نژاد برادر و يکي از مدافعان سرسخت او از مسووليتش در دفتر برادر کنار رفت و همين موضوع باعث بروز شايعاتي درباره روابط اين دو برادر شد که در وهله اول باورپذير به نظر نمي‌آمد، چرا که لااقل دوستان و آشنايان و همکاران داود در شهرک محلاتي تهران حمايت عجيب و غريب او را از برادرش ديده بودند . اما وقتي شايعات کمي بالا گرفت در 23 مرداد ماه 1387 رييس دفتر وقت محمود احمدي نژاد از کناره گيري داود احمدي نژاد از سمت رياست دفتر بازرسي ويژه رياست جمهوري به دليل مشکلات جسمي و توصيه پزشکان خبر داد. شيخ الاسلامي در آن روز در گفت‌وگو با ايسنا افزود: با توجه به اين امر، در حال حاضر سرپرستي اين بازرسي به عهده اينجانب است و مسووليت‌هاي محوله را انجام مي‌دهم. وي با بيان اين که «اين اتفاق دو سه هفته اي است که رخ داده است» تحليل برخي که معتقدند کناره گيري داود احمدي نژاد به دليل اختلاف نظر با رييس جمهور انجام شده را رد و تاکيد کرد: وي به علت مشکلات جسمي و توصيه پزشکان از اين سمت کناره گيري کرده است؛ زيرا پزشکان به وي توصيه کرده اند که از کارهاي پر تنش و سخت خودداري کنند.اين توضيحات اگر چه آن روزها تقريبا مورد قبول همه قرار گرفت اما گذشت زمان چيز ديگري را نشان داد.بر سر ماجراي استيضاح و سپس برکناري علي کردان از وزارت کشور بار ديگر اين خبر در محافل سياسي شنيده شد که يکي از افراد موثر در آن ماجرا داود احمدي نژاد بوده است و البته بعدها مخالفت او با جريان انحرافي مستقر در دولت نشان داد که جدايي اش از برادر درست بوده و فاصله‌ها روز به روز بيشتر مي‌شود، ضمن اينکه محمود احمدي نژاد هم چند بار در حرفهايش اين جدايي را تائيد کرد و از برادراني سخن گفت که در مقابل برادر مي‌ايستند و در اين راه تا مثال زدن از عقيل، برادر حضرت علي (ع) هم استفاده کرد!آبان 1387 داود احمدي‌نژاد از سوي رييس ستاد کل نيروهاي مسلح بعنوان دبير جديد کميته دائمي پدافند غيرعامل منصوب شد و در اين سمت بود که شروع به بيان ناگفته‌هايي از دولت برادرش کرد.وي دو سال بعد از جدايي از تشکيلات دولت، در مرداد 1389 در جمع دانشجويان و اساتيد دانشگاه تربيت معلم كرج گفت: «پنج سال پيش بعضي آقايان را ديديم كه در گيشه انقلاب نيستند و از اول مخالف حضور آنها در دولت شدم. يكي از آنها نيز فردي بود كه مدرك تحصيلي اش جعلي بود. چرا بايد كسي را به داخل صحنه بياوريم كه مدركش جعلي است به همين منظور من اطلاعات اين فرد را به افراد و مكان‌هاي مختلف دادم و اين كار نيز به خاطر منافع نظام و انقلاب بود.» اگرچه داود احمدي نژاد در اين سخنان كه خبرگزاري مهر به نقل از وي منتشر كرد،نگفته بود كه منظور وي از ميان كدام يك از كساني است كه نام شان در پرونده مدارك تحصيلي مجعول آمده است اما کاملا معلوم بود که منظور وي کيست!

اگرچه استيضاح كردان و بركناري وي و بعدها فوت نابهنگام او به مخالف خواني‌هاي داود احمدي نژاد در اين زمينه پايان داد اما گذشت زمان نشان داد وي همچنان نمي‌تواند از مخالفت با اسفنديار رحيم مشايي يار محبوب برادر دست بردارد و در اين سال‌ها يکي از مطرح ترين کساني بود که عليه جريان انحرافي سخن گفته و اين سخنان او بخصوص پس از خانه نشيني 11 روزه برادر در ماجراي عزل و انتصاب مجدد وزير اطلاعات در ارديبهشت 1390 شدت گرفت. وي در سخنان خود در سال 1389 گفته بود : «هيچ كس نمي‌تواند بگويد من با امام زمان(عج) ارتباط دارم و هر كسي كه اين جمله را بگويد با او بايد برخورد شود و سزايش نيز مرگ است».جالب اينجاست که گفته شود عليه داود احمدي نژاد افشاگري‌هاي زيادي شده است و از آن جمله مي‌توان به سخنان داود دانش جعفري وزير اقتصاد بركنار شده دولت نهم در نقد عملكرد و شيوه اعمال نفوذ وي در امور و نيز افشاگري عباس پاليزدار عليه وي اشاره كرد كه از جمله حاشيه‌هايي بودند كه در حوالي شخص برادر احمدي نژاد پديد آمدند اما در طول اين سالها، داود سعي کرده که در افشاگري، پيشروتر و موفقتر باشد!